Trường tiểu học Thạnh Lợi 2 được thành lập chính thức vào ngày 09/7/2009 theo quyết định số 3260/QĐ_UBND Huyện Vĩnh Thạnh. Tuy nhiên bề dày phát triển của trường được hình thành từ những năm cuối thập niên 50 của thế kỉ XX khi bắt đầu lập ấp (do đồng bào di cư từ Bắc vào Nam). Đầu tiên là các điểm trường nhỏ lẻ tại các họ đạo (nhà thờ Thiên Chúa) thành lập, mỗi điểm chỉ có 1 đến 2 phòng học (6 điểm/ 6 nhà thờ). Tên trường theo thời gian được thay đổi nhiều lần khác nhau theo địa bàn hành chánh Đến năm 1975 chính thức chuyển sang công lập do Nhà nước quản lý.
Theo thời gian có các tên gọi sau: khi còn thuộc xã Thạnh An từ năm 1975 đến 1980 tên trường là: trường TH Thạnh An B (liên trường Thạnh An); Khi có xã Thạnh Thắng từ năm 1980 đến 2009 tên trường đổi là Trường PTCS Thạnh Thắng 2 (chung cho cả 3 cấp học MN-TH-THCS) thuộc tuyến ấp B2 và Trường TH Thạnh Thắng 5 thuộc tuyến ấp C2 (chung cho cả 3 cấp học MN-TH-THCS); năm 2003 chia theo cấp học tuyến ấp B2 đổi tên trường thành Trường TH Thạnh Thắng 2, tuyến ấp C2 đổi tên trường thành Trường TH Thạnh Thắng 3.
Năm 2009 chia xã Thạnh Thắng làm 2 xã thành xã Thạnh Thắng và Thạnh Lợi đổi tên trường thành trường tiểu học Thạnh Lợi 2 (do sáp nhập ½ trường TH Thạnh Thắng 2 (ấp B2) và ½ trường TH Thạnh Thắng 3 (ấp C2).
Hiện nay trường tọa lạc trên địa bàn 2 ấp (C2&B2) thuộc xã Thạnh Lợi, địa bàn trường quản lý trải dài 12km/ 2 tuyến kênh, ấp B2 dài 6km, ấp C2 dài 6km. Phía Tây Bắc giáp huyện Thoại Sơn – An Giang, Đông Bắc giáp với trường TH Thạnh Lợi 1, phía Tây Nam giáp với huyện Tân Hiệp tỉnh Kiên Giang, phía Đông Nam giáp với Trường THCS Thạnh Thắng.
100% dân cư là người kinh, theo đạo Thiên Chúa trong đó 95% là người gốc miền Bắc di cư vào năm 1945, tổng số hộ dân 2 ấp là 938 hộ/4221 người (trong đó ấp C2: 461 hộ/2100 người, ấp B2: 477 hộ/2121 người). Người dân sống dọc bên hai tuyến kênh (kênh rộng 20m), chủ yếu sống bằng nghề nông, kinh tế thu nhập thấp.
Đường giao thông đã nâng cấp bê tông hóa, tuy nhiên vẫn còn một số đoạn đường trải cát núi nên giao thông đi lại vào mùa mưa lũ còn gặp khó khăn.