Trường Mẫu giáo Thuận An thành lập và đi vào hoạt động từ ngày 12 tháng 08 năm 2009, trường được chia tách từ trường mẫu giáo Thới Thuận. Trường tọa lạc tại Khu vực Thới An 1 – Phường Thuận An. Trường có 02 điểm, điểm trung tâm đặt tại Khu vực Thới An 1, điểm Vàm Bà Chiêu tại Khu vực Thới An 4.  Đầu năm học 2012 – 2013 trường mẫu giáo Thuận An  được UBND quận Thốt Nốt, Phòng giáo dục lập kế hoạch đầu tư, UBND phường Thuận An tìm quỹ đất và trường được khởi công xây dựng trên diện tích 3.971m²,  mới hoàn thành được đưa vào sử dụng với số tiền đầu tư 8 tỷ 040.000 đồng. Ngày 20 tháng 10 năm 2014, trường được Ủy ban nhân dân (UBND) Thành phố Cần Thơ kiểm tra và công nhận trường mầm non đạt chuẩn quốc gia mức độ 1 (Quyết định số 3054/QĐ-UBND  ngày 22 tháng 10 năm 2014 của UBND Thành phố cần Thơ).